Ex1.3 连接安装vasp的服务器

VASP的计算就跟开车一样，设计到很多的内容，比如大街上的路怎么铺的？桥怎么建的？发动机怎么工作的？方向盘怎么工作的，刹车片什么材料做的？车身颜色怎么喷的？ 没有人会懂所有相关的知识。但是怎么打开车门，坐车里，启动发动机，踩油门，打方向盘，这是本教程所关心的，也就是类似驾校教练指导你学会如何开车，而不是关系如何去造车，去铺路。要开车，必须手头上有车，这里的车，就是一个已经安装或者编译了VASP的服务器。下面是关于使用服务器的一些基本内容，新手也主要是从这几个方向入手，慢慢熟悉。

1. 知道怎么连接服务器

服务器主要分两种：自己课题组的和租的。不管哪种，都会有如何连接服务器，上传下载数据的基本说明。所以自己课题组有服务器，就去找老师或者师兄(姐)们，或者服务器管理员（一般也是师兄姐们）问以下。如果是租的服务器，可以找管理员咨询。然后照着说明，多练习几遍就够了。能连上服务器是至关重要的一步，因为你今后的计算都是在这个基础上，相当于拿钥匙开车门。 后面大师兄会介绍一些挂载服务器的方法，但这些基本的连接服务器操作是基础。一般来说通过终端（Terminal）来实现。下面根据电脑的系统简单介绍：

  • Windows下有很多软件可以参考。
  • Winscp + Putty 组合。前者实现传输，后者实现Terminal的功能
  • MobaXterm：传输和Terminal结合在一起。
  • Ubuntu 和 Mac：自带Terminal，可以直接用。

对于Windows， 当然还有其他好用的软件，大师兄平时很少用，能推荐的就这两个，尤其是MobaXterm。

2 Terminal 中的基本命令：

连上服务器后，面对的就是用Terminal进行一些基本的操作了。对于Terminal中的命令，你可以看作是把鼠标拖点的操作通过命令的方式来实现。但是通过命令更有效，这也是一个习惯和思维的转变过程。学习这些基本操作，最简单的方式就是在网上直接搜资料，关键词： Bash command， Shell Command， Bash 教程等等，当然，ChatGPT以及其他大模型也是非常好的选择。

  • 进入目录 : cd XXX （XXX是目录的名称，相当于双击文件夹）

  • 显示当前目录内容：ls （相当于双击后显示文件夹中的内容）

  • 移动文件(夹): mv A B （A B 都是文件的时候，执行重命名，A B 是文件夹的时候，把A移动到B中）

  • 复制文件: cp

  • 复制文件夹用: cp -r ; 注意 cp 和 -r 之间有个或者N个空格

  • 创建文件夹:mkdir

  • 删除文件: rm ;

  • 删除文件夹: rm -r

  • 强制删除文件夹: rm -fr 或者 rm -rf (f 和 r 的顺序可以颠倒 )

3. 服务器上安装/编译了VASP程序

使用VASP进行计算的时候，正常来说，需要准备两类文件：VASP的输入文件，以及运行VASP的脚本。输入文件我们后面会慢慢讲，这里你需要准备的就是这个脚本文件。

对于新手来说，最大的恩赐莫过于有一个可以直接使用的VASP程序。否则，你还得自己编译，受另一份非人的折磨。关于VASP的编译，后面会介绍。但是现在新手们需要做的事情就是：确保服务器上有一个可以正常运行的VASP程序。

  • 组里面已经安装好vasp程序，或者使用超算中心。跟前面的连接服务器一样，找服务器管理员或者自己的师兄师姐们帮忙给一个运行VASP的脚本。

  • 如果组里面有服务器，但是没有安装VASP：

  • 自己学着安装，但是可能会花费一些时间，虽然现在的安装已经很简单了，官网，视频网站，个人博客也有大量的教程。但新手对于Terminal中基本命令都还不熟悉，什么都不懂的时候，直接接触这个可能会很头疼。

  • 寻求帮忙，让你老板花上几百块钱，请个人帮你安装，顺便跟着学习下。比较推荐这一种，省时省力，还能学东西。

  • 如果购买的超算中心的机时，需要自己编译VASP：

  • 详细超算的管理员都已经早早给你准备好了对应的教程，主动联系寻求帮助。主要有两点：

    • 求助关于VASP的编译指南；
    • 求助VASP运行的脚本以及使用。

总结

1）学习VASP前，先保证自己能顺利连接到服务器，然后运行VASP。可以求助自己课题组中的师兄师姐，老板，服务器管理员，或者群里咨询。

2）在了解服务器连接，VASP任务提交的过程，是新手学习Terminal中命令操作的黄金时期。建议系统性学习Bash命令。多在网上搜资料，多多询问ChatGPT。

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